Fakultet informacijskih tehnologija, Univerziteta „Džemal Bijedić“ u Mostaru organizuje nastavu okviru univerzitetskog kampusa u Mostaru. Odvijanje nastavnog procesa prati adekvatna materijalna i kadrovska osnova. Na Fakultetu, u nastavnom procesu, angažovano je 6 nastavnika i 12 saradnika. Uspješno odvijanje nastave ne bi bilo moguće bez adekvatnih stručnih službi Fakulteta, koje su istovremeno servis, kako studentima tako i nastavnom osoblju.

Osnovnu organizacionu strukturu Fakulteta čine:

• Menadžment (dekan i prodekani za nastavu i naučno istraživački rad)
• Nastavno naučno vijeće
• Studentska služba
• Služba pravnih i kadrovskih poslova
• Služba za administraciju sistema i opreme
• Institut za informacijske tehnologije
• Laboratorija za softverski inženjering
• Laboratorija za informacijske sisteme
• Laboratorija za grafiku i multimedije
• Laboratorija za robotiku i inteligentne sisteme
• Laboratorija za sigurnost i zaštitu informacijskih sistema i
• Laboratorija za informacijske tehnologije u obrazovanju

Također, pri Fakultetu djeluju Cisco, Microsoft, Mikrotik i Redhat akademije kroz čije programe se mogu steći specijalistička znanja iz različitih oblasti informacijskih tehnologija. Fakultet ima vlastitu biblioteku, a studenti FIT-a imaju i pristup univerzitetskoj biblioteci koja je članica COBISS-a (kooperativni online bibliografski sistem i servisi).